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研究分野

分子化学生物学専攻 :
階層的構造ダイナミクス講座

研究

渡部 聡

助教 渡部 聡
キャンパス 片平 キャンパス
所属研究室 生体分子構造
連絡先 022-217-5605
E-mail stwata@tagen.tohoku.ac.jp
ホームページ http://www.tagen.tohoku.ac.jp/labo/inaba/
経歴

京都大学理学部理学科卒

京都大学大学院理学研究科博士課程単位取得退学

京都大学博士(理学)取得

理化学研究所播磨研究所・研究員,京都大学大学院理学研究科・特定研究員を経て、13年より現職

著書・論文
 
  1. Watanabe S*, Amagai Y*, Sannino S*, Tempio T, Anelli T, Harayama M, Masui S, Sorrentino I, Yamada M, Sitia R, Inaba K. (*equal contribution)
    Zinc regulates ERp44-dependent protein quality control in the early secretory pathway
    Nat Commun. 2019 Feb 5;10(1):603
  2. Kwon S*, Watanabe S*, Nishitani Y*, Kawashima T, Kanai T., Atomi H., and Miki K (*equal contribution)
    Crystal structures of a [NiFe] hydrogenase large subunit HyhL in an immature state in complex with a Ni chaperone HypA
    Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2018 115 (27) 7045-705
  3. Watanabe S, Harayama M, Kanemura S, Sitia R, Inaba K
    Structural basis of pH-dependent client binding by ERp44, a key regulator of protein secretion at the ER-Golgi interface
    Proc Natl Acad Sci U S A. 2017 Apr 18;114(16):E3224-E3232
  4. Maegawa KI, Watanabe S, Noi K, Okumura M, Amagai Y, Inoue M, Ushioda R, Nagata K, Ogura T, Inaba K,
    The Highly Dynamic Nature of ERdj5 Is Key to Efficient Elimination of Aberrant Protein Oligomers through ER-Associated Degradation.
    Structure. 25: 846-857 (2017).
  5. Arai K, Takei T, Okumura M, Watanabe S, Amagai Y, Asahina Y, Moroder L, Hojo H, Inaba K, Iwaoka M.
    Preparation of Selenoinsulin as a Long-Lasting Insulin Analogue
    Angew Chem Int Ed Engl. 2017 May 8;56(20):5522-5526. doi: 10.1002/anie.201701654
  6. Ushioda R, Miyamoto A, Inoue M, Watanabe S, Okumura M, Maegawa KI, Uegaki K, Fujii S, Fukuda Y, Umitsu M, Takagi J, Inaba K, Mikoshiba K, Nagata K.
    “Redox-assisted regulation of Ca2+ homeostasis in the endoplasmic reticulum by ERdj5"
    Proc Natl Acad Sci U S A. 2016 Oct 11;113(41):E6055-E6063
  7. Watanabe S, Kawashima T, Nishitani Y, Kanai T, Wada T, Inaba K, Atomi H, Imanaka T, Miki K
    Structural basis of a Ni acquisition cycle for [NiFe] hydrogenase by Ni-metallochaperone HypA and its enhancer.
    Proc Natl Acad Sci U S A. 2015 Jun 3;112(25):7701-6.
  8. Tominaga T, Watanabe S, Matsumi R, Atomi H, Imanaka T, Miki K.
    Crystal structures of the carbamoylated and cyanated forms of HypE for [NiFe] hydrogenase maturation.
    Proc Natl Acad Sci U S A. 110(51):20485-90 (2013)
  9. Watanabe S, Matsumi R, Atomi H, Imanaka T, Miki K.
    “Crystal structures of the HypCD complex and the HypCDE ternary complex: transient intermediate complexes during [NiFe] hydrogenase maturation”
    Structure 20, 2124-2137, 2012
  10. Watanabe S, Kita A, Kobayashi K, Miki K
    "Crystal structure of the [2Fe-2S] oxidative-stress sensor SoxR bound to DNA"
    Proc Natl Acad Sci U S A, 105, 4121-6 (2008)
  11. Watanabe S, Matsumi R, Arai T, Atomi H, Imanaka T, Miki K
    "Crystal structures of [NiFe] hydrogenase maturation proteins, HypC, HypD, and HypE: insights into the cyanation reaction by thiol redox signaling"
    Molecular Cell, 27, 29-40 (2007)
所属学会

日本蛋白質科学会,日本結晶学会,日本生化学会,日本生物物理学会

最近の研究について

 タンパク質の働きを深く理解するためには、タンパク質の立体構造を原子レベルにおいて「目で見ること」が必要です。X線結晶構造解析は、立体構造を解明する上で最も強力な手法です。現在は、小胞体におけるカルシウムイオン制御機構や、金属タンパク質の成熟化機構について,X線結晶構造解析を基盤にした研究を行っています。特に、生体内で一時的に形成されるタンパク質複合体について、結晶構造解析によって立体構造を明らかにし、タンパク質同士がどのように連係し機能しているかを解明することを目指しています.

メッセージ

 研究を通して、サイエンスの面白さや、研究の醍醐味を体感しながら、どの分野に進んでも通用する基礎力を培って欲しいと思います。