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研究分野

脳生命統御科学専攻 :
協力教員

研究

生体インタラクション 分野

生体インタラクション 分野

本分野は、大規模データ解析を駆使して、がんによって個体が不調に陥るのはなぜか、日々のストレスと老化の関係はどのようなものか、デバイスの利用は生体にどのような影響をあたえるのか、といった問いに答えようとしています。近年の技術革新により、生命科学・医学分野で得ることのできる情報の量は飛躍的に増えました。いまやゲノム全体の配列を知ることは難しくありません。ある細胞における 2 万種類以上の遺伝子の発現量や数百の代謝物の量を網羅的に測定することもできます。個々人が持つ背景情報 (年齢や性別、既往歴など) の蓄積にも目をみはるものがあります。技術革新の一方で、新たな課題も生まれました。大規模なデータが得られても、得られた情報が何を意味するのかを解釈することが難しい場合があるのです。異なる階層のデータ同士 (たとえば遺伝子発現の情報と疾患の既往歴) を結びつけることが困難である場合も多々あります。解釈しやすいデータを得るためにはどうすれば良いか、得られた大規模データから有用な情報を抽出するにはどうすべきか、これらの基本的な問題を考えることの重要性が増しています。生体インタラクション分野では、上記のデータ科学の考え方に基づき、生体の多様な相互作用(インタラクション)を理解することを目指して、次の3つの課題に取り組んでいます。

(1) がんにより個体に不調が生じるしくみ(がんと個体のインタラクション)
(2) 非コードゲノム領域による代謝・免疫・老化制御機構(分子間インタラクション)
(3) 日常的なアクティビティや社会環境がヒトに与える影響(環境とヒトのインタラクション)
 

特色・実績

研究室には空間遺伝子発現解析装置Xeniumや質量分析計、サイトカイン測定装置、脳波計など、さまざまな計測機器が揃っています。これらの計測機器によって得られたデータを解析することにより、がんに起因する宿主の病態生理やエンハンサーの機能を明らかにしてきました。これらの計測機器はどのような対象にも適用できることが特色で、興味のある問題さえ固まっていれば、問題解決のためのツールを駆使してその問題を解くことができます。
 
  1. Hojo et al. Nat Commun. 2019 Jun 13;10(1):2603. doi: 10.1038/s41467-019-10525-1.
  2. Mizuno et al. Nat Commun. 2022 Jun 15;13(1):3346. doi: 10.1038/s41467-022-30926-z.
  3. Vandenbon et al. Commun Biol. 2023 Jan 24;6(1):97. doi: 10.1038/s42003-023-04479-w.
  4. Maeshima et al. eBioMedicine 2024 Sep:107:105271. doi: 10.1016/j.ebiom.2024.105271.
  5. Nakamura et al. Cancer Sci. 2024 Mar;115(3):715-722. doi: 10.1111/cas.16078
     
研究室URL https://www.charlie-bioanalytics.com/

教員紹介

教授 河岡 慎平
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  • がんによって個体に不調が生じるのはなぜか
  • エンハンサーによる代謝・免疫・老化制御
  • 日常のアクティビティが人間に与える影響に関する研究